清远麻鸡产于广东省清远市，已有千年历史，具有“一楔、二细、三麻身”的独特外貌特征，以其皮色金黄、肉质嫩滑、皮爽骨软、鲜香味美、风味独特而享誉国内外。清远麻鸡作为“国宴用鸡”，享有“岭南第一名鸡”美誉，2023年成为鸡中唯一入选国家十大优异畜禽的遗传资源，是广东省地方优质鸡的靓丽名片。

　　清远麻鸡作为国家“地理标志保护产品”，通过三品建设和四链融合，实现了全产业化发展，仅广东省内其年上市量超过2.1亿只，年产值超100亿元，其以单一地方鸡入围建设国家级现代农业产业园，成为全国唯一获巴拿马金奖的地方优质鸡，2022年入选农业品牌精品培育计划，拥有“贵州茅台酒，清远凤中皇”的美誉，是我国优质地方鸡品种开发利用的典范。为了更好促进清远麻鸡的种业创新和产业可持续的健康发展，充分利用现代分子育种技术，加快提高清远麻鸡生产性能，支撑新品种（配套系）的培育，我们成功研发创制“粤芯一号”——清远麻鸡50K靶向捕获育种芯片，这对产业化发展升级将会起极大促进作用。

　　“粤芯一号”清远麻鸡50K育种芯片

　　位点严格挑选

　　· 基于8个品系2000多个样本重测序（10X）数据，通过严格质控获得高质量的全基因组变异位点，适用于清远麻鸡的遗传改良和基础研究。

　　· 通过GWAS分析筛选生长性状、屠宰性状、繁殖性状、饲料报酬等作为重要的候选位点。

　　液相平台支持

　　· 灵活性高：基于探针杂交靶向捕获测序技术，可以根据需求增加标记位点，升级芯片及扩展应用场景灵活。

　　· 性价比高：基于国产化设计、检测和分析流程，大大降低分型成本，采用自动化检测流程，提升检测通量和稳定性。

　　位点在染色体上的分布

　　图1 芯片位点在染色体上的分布图

　　位点MAF分布

　　图2 芯片位点MAF分布

　　位点注释情况

　　图3 位点注释情况

　　重复性

　　通过对3组重复样本进行分型，显示平均分型一致率达到99.51%。

　　图4 重复样本分型一致性

　　检出率

　　150个样本中平均测序深度5x以上的样本检出率达到了99.73%，部分样本检出率分布图如下：

　　图5 样本检出率分布图

　　分型结果平博pinnacle体育

　　对5个不同选育方向的专门化品系及文昌鸡验证群体进行分型验证，显示开发的液相芯片对不同性状选育群体及相关品种分型准确性高平博。

　　图6 验证群体PCA结果

　　图7 验证群体进化树分析结果

　　佛山科学技术学院家禽智能育种与种质创新团队隶属于广东省普通高校畜禽精准育种创新团队，依托广东省动物分子设计与精准育种重点实验室，团队长期围绕地方优质家禽资源，解析优良种质特性及生产效率性状的形成过程和遗传调控机制，构建精准分子设计高效育繁推技术体系，创制新育种材料和新品种。

　　团队现有成员12人，包括教授1名、副教授4名，团队具有多样化的国际学术背景和学科基础。团队带头人李华，二级教授、博士生导师、国务院政府特殊津贴获得者，主持培育天农麻鸡新配套系，主持获全国农牧渔业丰收奖、广东省科技进步奖等科技奖6项，受聘国家畜禽遗传资源委员会家禽Ⅰ专业委员会委员、中国畜牧兽医学会动物福利与健康养殖分会副理事长、广东省畜牧遗传资源委员会（大委员会）委员、广东省动物遗传育种分会副理事长；现担任佛山科学技术学院生命科学与工程学院院长、广东省动物分子设计与精准育种重点实验室主任、广东省畜禽育种工程中心主任、广东省“冲补强”畜牧学科和珠江学者设岗学科带头人、广东省畜禽精准育种创新团队负责人。

　　近五年，团队先后承担国家生物育种专项、国家自然科学基金国际合作项目和面上项目等国家级课题12项，总项目62项，发表研究论文73篇，包括Science China Life Sciences、Briefing in Bioinformatics、Food Chemistry、Molecular Biology and Evolution等一区论文5篇，获授权发明专利12件、实用新型专利35件、软件著作权4个，参与起草地方标准5个，获得全国农牧渔业丰收奖一等奖等科技奖励，主持获批全国农业专业学位研究生实践培育基地、广东省高校创新团队、广东省重点实验室、广东省高校重点实验室、佛山市畜禽繁育研究中心5个重点平台，在清远麻鸡种质资源挖掘与开发利用、鸡表型智能识别技术研发和应用、家禽复杂性状遗传调控机制解析、地方品种基因组育种技术体系构建和新品种培育、地方家禽品种资源评价技术体系构建等方面取得了系列进展。